Joukoilla on erilaisia "harvinaisuuksia", jotka määrittävät kortin kokonaisarvon ja -voiman sekä joukon loitsujen ja ominaisuuksien voiman.

Harvinaisuuksia on 6 erilaista, ja niiden arvo kasvaa. Harvinaisuudet tunnistaa joukkojen korttia reunustavasta väristä. Harvinaisuutta voi korottaa joukkoja ylentämällä, mutta joukon perusharvinaisuus määrittää sen kokonaisvoiman vähimmäistason. 

Harvinaisuustasot ja niiden värit

• Yleinen (alin arvo): valkoinen

• Harvinainen: vihreä

• Erittäin harvinainen: sininen

• Eeppinen: violetti

• Legendaarinen: kulta

• Myyttinen (korkein arvo): syaani 

Harvinaisuustason arvo

Yleiset joukot

Yleiset joukot ovat helpoimpia hankkia. Niillä on tavanomaisen 2 manavärin sijaan 1 manaväri, mutta niiden täyttämiseen ei tarvita paljon manaa. Yleisillä joukoilla on alhaisemmat arvot jopa täysin parannettuina, ja niiden kyvyt ovat yksinkertaisia: niiden loitsussa on vain yksi tai kaksi toimintoa. Loitsut ovat usein riippuvaisia jonkin muun tapahtumisesta, kuten Zombie, joka saa 9 elämää poistettujen pääkallojen määrän vahvistamana. Yleisillä joukoilla ei ole yksilöllisiä nimiä. 

Harvinaiset joukot

Harvinaiset joukot ovat hieman harvinaisempia kuin yleiset kortit, mutta niiden arvot ovat korkeammat. Ne voivat kerätä manaa kahdesta väristä, ja niiden manakustannus on yleensä 8–11. Niiden loitsuilla on paremmat arvot ja laaja valikoima kykyjä, jotka kattavat hyökkäyksen, puolustuksen ja vahvat hyötyvaihtoehdot. Harvinaisia joukkoja löytyy usein vahvoista synergioista voimakkaampien joukkojen kanssa, sillä ne ovat riittävän yleisiä noustakseen korkeaan harvinaisuuteen, mutta niiden loitsuilla on silti monipuolisia toimintoja.

Erittäin harvinaiset joukot 

Erittäin harvinaisten joukkojen manakustannus on yleensä 11–12, mutta tällä tasolla loitsut alkavat sisältää räjähdyksiä, jalokivimuunnoksia ja muita loitsuvaikutuksia. Niiden kyvyt, arvot ja ominaisuudet tekevät niistä hyödyllisiä useimmissa pelin vaiheissa. Ne ovat erityisen hyödyllisiä pelin alkuvaiheessa loitsujen laajan valikoiman ja saatavilla olevien loitsujen voiman vuoksi, samalla kun ne ovat edelleen suhteellisen helppoja hankkia. Riittävän monen erittäin harvinaisen joukon ylentäminen ja tason nostaminen voi antaa valtavan lisäyksen niiden arvoihin ja loitsuvoimiin. Oikein käytettyinä ne voivat olla yhtä voimakkaita kuin jotkin legendaariset ja myyttiset joukot.

Eeppiset joukot 

Eeppiset joukot ovat yleisimpiä joukkoja, joita löytyy harvinaisten joukkojen, kuten korkeiden arvojen sekä voimakkaiden ominaisuuksien ja loitsujen legendaaristen ja myyttisten joukkojen, alapuolelta. Niiden loitsut sisältävät yleensä useita toimintoja ja aiheuttavat suuren määrän vahinkoa, ja näiden joukkojen riittävä parantaminen voi tehdä niistä yhtä voimakkaita kuin legendaarisista tai myyttisistä joukoista. Niiden manakustannus on yleensä 11–13, ja eeppisten joukkojen ominaisuudet ovat paljon kalliimpia kuin erittäin harvinaisten. Eeppisen tai sitä korkeamman harvinaisuuden joukoilla on nimet.

Legendaariset joukot

Legendaariset joukot muodostavat suurimman osan Gems of Warissa löytyvistä vahvimmista joukoista, ja niiden keskimääräinen manakustannus on yli 15. Vahvempien kykyjensä ja korkeampien arvojensa lisäksi jokaisella legendaarisella joukolla on omat ainutlaatuiset "legendaariset ominaisuutensa", jotka ovat tavallisia ominaisuuksia vahvempia ja tarjoavat tiimisynergiaa käytettäessä. Useimmat loppupelin tiimit koostuvat pääosin legendaarisista joukoista.

Myyttiset joukot

Voimakkaimpia ja äärimmäisen harvinaisia joukkoja kutsutaan "myyttisiksi" joukoiksi. Pelissä on vain vähän myyttisiä joukkoja verrattuna harvinaisiin tai edes legendaarisiin joukkoihin: myyttisillä joukoilla on korkea, yleensä yli 20:n manakustannus, 2–3 osaa loitsuissaan, vahvemmat legendaariset ominaisuudet ja erittäin korkeat taidot. Myyttisten joukkojen ominaisuudet voivat tarjota paljon hyötyä muille tiimin joukoille.